Las relaciones comerciales entre la UE e Indonesia se basan en el Acuerdo Bilateral de Asociación y Cooperación [PDF] [866 KB], en vigor desde el año 2014, y que contiene cuestiones relativas a la cooperación en diferentes ámbitos. Indonesia se beneficia del régimen general del Sistema de Preferencias Generalizadas (SPG), lo que permite el acceso de sus productos al mercado de la UE en condiciones preferenciales.

En abril de 2007, el Consejo de la Unión Europea autorizó a la Comisión Europea a negociar un acuerdo de libre comercio con la Asociación de Naciones del Sudeste Asiático (ASEAN), de la que es miembro Indonesia. No obstante, en diciembre de 2009, tras la suspensión de las conversaciones de región a región, se decidió proseguir las negociaciones con cada uno de los Estados miembros de ASEAN de manera individual. Pese a ello, se mantiene el objetivo estratégico de negociar un acuerdo UE-ASEAN, cuando las condiciones sean propicias.

El 18 de julio de 2016, el Consejo de la UE autorizó la apertura de negociaciones para un Acuerdo de Libre Comercio entre la UE e Indonesia, bajo el marco del Acuerdo Bilateral de Asociación y Cooperación. Tras un período de estancamiento, las negociaciones se reanudaron a finales de 2020, al levantarse la prohibición de facto a la importación de bebidas alcohólicas procedentes de la UE.

La UE e Indonesia han acordado negociar un acuerdo ambicioso que facilite el comercio y las inversiones, y que abarque una amplia gama de cuestiones, como los derechos de aduana y otros obstáculos al comercio, los servicios y las inversiones, el acceso a los mercados de contratación pública, así como las normas de competencia y la protección de los derechos de propiedad intelectual. El acuerdo también incluirá un amplio capítulo destinado a garantizar que las relaciones económicas vayan de la mano de la protección del medioambiente y los derechos sociales. El objetivo es celebrar un grado de cobertura similar al que la UE ha logrado en sus acuerdos comerciales con Singapur y con Vietnam.