El marco jurídico básico de las relaciones comerciales bilaterales entre Paraguay y la UE se recoge en el Acuerdo Marco de Cooperación CEE-Paraguay, de 1991, que otorga a ambas partes el trato de nación más favorecida, es decir, se trata de un Acuerdo no preferencial.

Además, como país miembro del Mercado Común del Sur (MERCOSUR), las relaciones bilaterales entre Paraguay y la UE también se rigen por el Acuerdo Marco Interregional de Cooperación entre la UE y el MERCOSUR, firmado en 1995, y en vigor, desde 1999.

La UE está negociando un acuerdo de libre comercio con Paraguay, como parte de las negociaciones del Acuerdo de Asociación de la UE con los países del Mercosur (que también incluye a Brasil, Argentina y Uruguay). El 28 de junio de 2019, la UE y Mercosur alcanzaron un acuerdo de principio.

Paraguay es país miembro de la Organización Mundial del Comercio desde su creación en 1995.